Разнообразие генетических линий SARS-CoV-2: Как они влияют на пандемию?
Вирусы, такие как SARS-CoV-2, постоянно развиваются, поскольку изменения в генетическом коде (генетические мутации) происходят во время репликации генома . Линия — это группа близкородственных вирусов с общим предком. SARS-CoV-2 имеет много родословных; все вызывают COVID-19. Генетические линии SARS-CoV-2 появляются и циркулируют по всему миру с начала пандемии COVID-19.
Omicron — новый вызов в борьбе с COVID-19
30 ноября 2021 года Межведомственная группа правительства США по SARS-CoV-2 (SIG) классифицировала Omicron как вариант, вызывающий озабоченность (VOC) . Эта классификация основывалась на следующем:
- Выявление случаев, связанных с Omicron, в нескольких странах, в том числе среди тех, у кого нет истории поездок.
- Трансмиссия и замена варианта Delta в Южной Африке.
- Количество и расположение замен в шиповидном белке.
- Имеющиеся данные для других вариантов с меньшим количеством замен в шиповидном белке указывают на снижение нейтрализации сывороткой вакцинированных или выздоравливающих лиц.
Имеющиеся данные для других вариантов с меньшим количеством замен в шиповидном белке, которые указывают на пониженную восприимчивость к определенным видам лечения моноклональными антителами.
Трансмиссивность и потенциальные опасности варианта Омикрон
В настоящее время неизвестно, насколько эффективно вариант Омикрон может передаваться от человека к человеку. Замена Delta на Omicron в качестве преобладающего варианта в Южной Африке вызывает опасения, что вариант Omicron может быть более заразным, чем Delta, но из-за небольшого числа случаев в Южной Африке, когда появился Omicron, неясно, является ли этот вариант более заразным. чем вариант Дельта. Кроме того, относительно небольшое количество задокументированных на сегодняшний день случаев затрудняет оценку трансмиссивности. Анализ изменений в шиповидном белке показывает, что вариант Омикрон, вероятно, имеет повышенную передачу по сравнению с исходным вирусом SARS-CoV-2, но трудно сделать вывод, является ли он более трансмиссивным, чем Дельта.
В настоящее время неясно, связана ли инфекция с вариантом Омикрон с более тяжелым заболеванием. Из-за небольшого числа случаев, связанных с вариантом Омикрон, оценка тяжести заболевания затруднена. Предварительная информация из Южной Африки указывает на отсутствие необычных симптомов, связанных с инфекцией варианта Омикрон, и, как и в случае с другими вариантами, у некоторых пациентов симптомы отсутствуют.
Иммунный ответ на вариант Омикрон: Международные усилия и текущие данные
Влияние на вакцино-индуцированный иммунитет или иммунитет от предыдущей инфекции: в настоящее время нет доступных данных для оценки способности сыворотки вакцинированных лиц или лиц, ранее инфицированных SARS-CoV-2, нейтрализовать вариант Omicron. Тем не менее, SIG правительства США и глобальные партнеры в области общественного здравоохранения работают над получением этих данных в лабораторных условиях, а также будут продолжать отслеживать эпидемиологические и клинические показатели.
Спайковый белок является основной мишенью иммунитета, индуцированного вакциной. Вариант Omicron содержит больше изменений в шиповидном белке, чем наблюдалось в других вариантах, в том числе 15 в RBD. Основываясь на количестве замен, расположении этих замен и данных по другим вариантам с аналогичными заменами шиповидных белков, ожидается значительное снижение нейтрализующей активности сывороток вакцинированных или ранее инфицированных лиц, что может указывать на снижение защиты от инфекции.
Лабораторные и эпидемиологические исследования необходимы для оценки влияния варианта Омикрон на эффективность вакцины и прорывные инфекции, в том числе у лиц, получивших бустерные дозы. Однако ожидается, что вакцинация по-прежнему будет обеспечивать защиту от госпитализации и смерти, а вакцины по-прежнему играют решающую роль в борьбе с пандемией COVID-19.
Влияние варианта Омикрон на лечение моноклональными антителами
В настоящее время нет данных по конкретным вирусам, позволяющих оценить, сохранит ли лечение моноклональными антителами эффективность против варианта Omicron. Основываясь на данных по другим вариантам со значительно меньшими изменениями в RBD, ожидается, что вариант Omicron останется чувствительным к некоторым видам лечения моноклональными антителами, в то время как другие могут иметь меньшую эффективность. Ученые работают над тем, чтобы узнать больше о варианте Omicron, чтобы лучше понять, насколько легко он может передаваться, и эффективность разрешенных или одобренных в настоящее время медицинских контрмер, таких как вакцины, терапевтические средства и диагностические тесты, против этого варианта. Быстро появляется новая информация о вирусологических, эпидемиологических и клинических характеристиках варианта Омикрон.