Понимание реинфекции COVID-19: причины и последствия
В последнее время в некоторых странах мира зафиксированы случаи повторного заражения (реинфекции) возбудителем новой коронавирусной инфекции под названием COVID-19. Также установлено, что если человек заболевает снова, то это, скорее всего, связано со встречей с другим вариантом той же инфекции. Кроме того, известно, что в этом случае заболевание может протекать в тяжелой форме.
Каждый вирус имеет свой собственный геном - уникальную специфическую последовательность ДНК или РНК.
Механизмы мутации вируса SARS-CoV-2 и их влияние на пандемию
Коронавирус SARS-CoV-2 представляет собой самосборную наночастицу, внутри которой находится одноцепочечная РНК (рибонуклеиновая кислота) (рис. 1). Геном SARS-CoV-2 представляет собой длинную последовательность РНК, состоящую почти из 30 000 символов (нуклеотидов), которые работают в строгой последовательности. Этот порядок может измениться: если каждая новая копия вируса собрана в одном из этих соединений, может произойти ошибка — замена одного нуклеотида другим — и в результате код всей цепи немного изменится.
Вирусы постоянно меняются в результате мутаций. Вариант имеет одну или несколько мутаций, которые отличают его от других вариантов, находящихся в обращении.
Глобальное воздействие вариантов COVID-19: от Альфы до Дельты
Как и ожидалось, на протяжении всей этой пандемии в Соединенных Штатах и во всем мире было задокументировано несколько вариантов SARS-CoV-2. Чтобы информировать о местных расследованиях вспышек и понимать национальные тенденции, ученые сравнивают генетические различия между вирусами, чтобы определить варианты и то, как они связаны друг с другом. Для содействия публичному обсуждению вариантов ВОЗ предложила использовать метки, состоящие из греческого алфавита, например, Альфа, Бета, Гамма, в качестве практического способа обсуждения вариантов ненаучной аудиторией.
Ключевые мутации и их влияние на распространение и заразность COVID-19
- Альфа — «британский» штамм — появился в сентябре 2020 года. Наиболее важные мутации, которые он содержит: - N501Y (данная мутация делает вирус более заразным). ВОЗ сообщила, что «британский» штамм коронавируса был выявлен как минимум в 60 странах.
- Бета — «южноафриканский» штамм — появился в мае 2020 года. Последняя мутация считается самой опасной - вирусы с мутацией способны эффективнее уклоняться от антител, полученных из плазмы крови пациентов, выздоровевших после COVID-19. Ученые предупредили, что штамм, обнаруженный в Южной Африке, передается примерно на 50% быстрее и преодолевает некоторые антитела, вырабатываемые в ответ на другие варианты вируса.
- Гамма — «бразильский» штамм — появился в ноябре 2020 года. Он обладает устойчивостью к иммунитету, приобретенному после первой волны коронавируса. Итак, основная мутация коронавируса содержится в гене, кодирующем синтез S-белка («шипа», Spike). Данная мутация характерна и для двух других штаммов — «южноафриканского» и «бразильского». Эта мутация, изменяет форму «шипа» (S-белка), с помощью которого он эффективнее прикрепляется к рецептору ACE2. По данным авторов, «британский» штамм с указанной мутацией на 50-70% заразнее, чем классический вирус SARS-CoV-2.
- Дельта — «индийский» штамм — появился в октябре 2020 года.
Для него характерна значительно повышенная заразность, если сравнивать с исходным уханьским и даже «британским» (альфа, B.1.1.7) вариантами. Этот вариант SARS-CoV-2 самой распространенной линии B, который несет несколько потенциально важных мутаций, в том числе и в S-белке. Стоит отметить характерную для варианта дельта мутацию P681R в районе общей для всех вариантов так называемой «фуриновой вставки». Эта вставка — небольшой фрагмент S-белка, в котором перед проникновением в клетку может проходить его разрезание. Дельта штамм очень заразен, почти в два раза более заразен, чем предыдущие варианты. В двух различных исследованиях, проведенных в Канаде и Шотландии, пациенты, инфицированные Дельта-вариантом, с большей вероятностью были госпитализированы, чем пациенты, инфицированные Альфа-или исходными штаммами вируса. В научной литературе не описаны клинические особенности дельта штамма.