СОВРЕМЕННЫЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ О МУТАЦИЯХ КОРОНАВИРУСА. МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ И КЛИНИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ЦИРКУЛИРУЮЩИХ ШТАММОВ
Еще в первую волну пандемии в 2020 году был вебинар от китайских специалистов по ковид, в котором говорили о мутациях данного вируса, коих было выявлено за зимний и весенний период в Китае 149 штаммов. Букв латинского алфавита не хватит, чтобы их все обозначить. По словам Анчи Барановой, профессора школы системной биологии Университета Джорджа Мейсона, вирус мутирует благодаря попаданию его в ослабленный организм, при длительном течение болезни, и при переливании плазмы с антителами заболевшему пациенту. Поэтому важно наблюдать за количеством антител класса М, если они есть, то иммунитет еще не сформирован, а значит, таким пациентам нельзя проводить вакцинацию, нельзя встречаться с вирусом заново, потому что есть риски возникновения мутаций длительно персистирующего в организме вируса. Важно, чтобы ПЦР был отрицательным трижды перед тем, как выписывать пациента после долгой болезни, такой человек так же является угрозой в плане возникновения и распространения мутации в генах вируса.
Мутация представляет собой молекулярно-биологический процесс, когда в процессе вирусной репликации происходят «сбивки» на этапах транскрипции и трансляции, т.е. во время «перезаписи» генетического кода с РНК вируса на ДНК клетки хозяина. Такие ошибки в ДНК приводят к формированию измененных генов, кодирующих белки вируса, вследствие чего появляются такие новые вирусы-мутанты, с измененными свойствами собственных белков.
Главные мутации короновируса происходят в гене гликопротеинового S-белка. Так, мутация в S белке приводит к замене аспарагиновой аминокислоты (сокращенно D) на аминокислоту глицин (сокращенно G). Американские исследователи экспериментально показали, что давно обсуждаемая мутация D614G в гене S-белка коронавируса SARS-CoV-2 повышает его инфекционность, поэтому данный вариант вируса распространяется быстрее. Вирусный белок с такой мутацией также и более стабилен. Мутации в рецептор-связывающем домене (RBD-receptor binding domain), обладают более высоким сродством к рецептору ангиотензин-превращающего фермента 2 типа (АСЕ2) эпителиальных клеток человека, что позволяет коронавирусу увереннее в них проникать.
В настоящее время известно несколько мутаций, которые являются особенно контагиозными, против которых вакцины имеют более низкий процент эффективности, а значит, есть вероятность того, что они будут являться основой для новых мутаций.
«Британский» штамм коронавируса. Наиболее важные мутации, которые он содержит: - N501Y (данная мутация делает вирус более заразным).
«Южноафриканский» штамм коронавируса. B.1.351 и 501Y. V2. Последняя мутация считается самой опасной - вирусы с такой мутацией способны эффективнее уклоняться от антител, полученных из плазмы крови пациентов, выздоровевших после COVID-19.
«Бразильский» штамм коронавируса. B.1.1.248. Основная его мутация содержится в гене, кодирующем синтез S-белка («шипа», Spike). Данная мутация характерна и для двух других штаммов — «южноафриканского» и «бразильского». Эта мутация, изменяет форму «шипа» (S-белка), с помощью которого он эффективнее прикрепляется к рецептору ACE2. По данным авторов, «британский» штамм с указанной мутацией на 50-70% заразнее, чем классический вирус SARS-CoV-2.
«Испанский штамм» коронавируса - линия 20A.EU1, основная мутация в S-белке. Иммуноглобулины менее эффективно нейтрализуют «испанский» штамм коронавируса.
«Калифорнийский» штамм. Открыт в США - CAL.20C.
«Румынский» штамм – разновидность «британского» - устойчив к вакцинам.
Сибирский и Северо-западный штамм короновируса. Это вновь формируемые новые мутации на территории России. Мутации в этом штамме также происходят в зоне гена, ответственного за S-белок.
индийские «дельта»-варианты линии B.1.617.
«Йота» штамм. B.1.526 способен обходить иммунную защиту примерно у десяти процентов ранее инфицированных людей. Этому способствует наличие двух специфических мутаций E484K и S477N, каждая из которых определяет разновидность «йота»-варианта
По данным Роспотребнадзора на 16 апреля 2021 года в РФ идентифицированы 192 образца британского штамма, 21 – южноафриканского штамма.
Японские ученые, в частности Yoriyuki Konno с соавторами в работе 20 года показали, что белок, экспрессируемый с гена ORF3b нового коронавируса SARS-CoV-2 сильно подавляет синтез интерферонов I типа у пациентов с COVID-19./ При этом вирус чувствителен к интерферонам, что говорит об их потенциальной эффективности для терапии коронавирусной инфекции. Такое заявление в очередной раз подтверждает очевидность эффективности виферона при лечении ковид.
В этой связи, в клиническом плане представляется целесообразным в качестве мер активной противовирусной защиты обеспечить пациентам назначение препаратов рекомбинантного интерферона –α2b с антиоксидантами, как в довакцинный период, когда идет процесс образования вируснейтрализующих антител, так и в поздний поствакцинный период, когда титр антител после проведенной вакцинации начинает снижаться.