Комьюнити

Мутации штамма омикрон (кентавр, дельтакрон и др.) в контексте развития пандемии инфекции covid -19

Вирусы имеют такую особенность – мутировать, такова их природа, и сколько бы человечество не искало конечную точку в секвенировании геномов вирусов, у них всегда найдется новый вариант. Так происходит и с ковидом. Геном SARS-CoV-2 – это длинная последовательность РНК, состоящая примерно из 30 тысяч элементов, идущих в строгом порядке друг за другом. Каждый раз, когда происходит репликация вируса, этот порядок меняется, вызывая все новые и новые мутации. Чаще всего эти мутации не несут никакой значимости для вируса, но иногда они проявляются новыми свойствами вируса, например, вирус становится более заразным, меняется скорость его распространения, его патогенность.

Сначала все страдали от штамма Альфа, потом на смену ему пришел Дельта, затем были Гамма вирус, Бетта вирус, и наконец Омикрон. Пока это последний штамм ковида, который сам начал мутировать достаточно активно. Если в Дельта вирусе отмечалось 9 мутаций, то в Омикроне 32 мутации в белке Spike. Появление новых мутаций вируса не вызывает особого беспокойства ученых, пока новые свойства вируса не придают ему повышенную трансмиссивность и способность избегать иммунного ответа хозяина. Омикрон является наиболее активным вирусом, с момента его появления в мире зарегистрировнно более 80 миллионов случаев заражения этим штаммом. Несмотря на более легкое течение болезни, вызыванное омикроном, была и летальная статистика.

Мутации вируса с начала пандемии называют буквами греческого алфавита, подвиды Омикрона обозначили буквой В. Уже известны В1, В2, В4, В5. Омикрон В1 был наиболее активен с прошлой осени до начала зимы 22 года, когда на смену ему пришел В2. С конца весны этого года В2 активно вытесняется новыми подвидами омикрона В4 и В5. Впервые эти 2 штамма были зарегистрированы во Франции в марте и на Кипре в мае 2022 года.

Но, даже если количество новых мутаций не так много, некоторые из них достаточно сложные. Ученые уже выявили, что мутация 452R белка Spike показывает бОльшую степень сходства с человеческим рецептором ACE2, используемым вирусом для попадания в наши клетки. Мутация 486V, которая находится в белке Spike, дает вирусу уникальную способность уклоняться от иммунитета хозяина, будь то активный или пассивный иммунитет.

В России «Дельтакрон» был секвенирован весной этого года, но на него почти не обратили внимания. Скорей всего, он возник в результате ко-инфекции, когда произошло одновременное инфицирование одного хозяина двумя вирусами Дельта и Омикрон. Его относят к разряду гибридных вирусов. Дельта штамм почти исчез, что вызвало сомнение по поводу обнаружения Дельтакрона, но затем через ряд проверок на геномы вирусов его обнаружили еще несколько раз и зафиксировали, как новый подвид Омикрона. Насколько он опасен, еще не известно, но учитывая способность Дельты поражать легкие, с Дельтакроном нужно быть предельно внимательными в плане появления новых симптомов.

Один из новых вариантов под названием «Кентавр» относится к Омикрону B 2.75. В августе 2022 его взяли под особый контроль международного сообщества на основании его мутационного профиля. По сравнению с B2, BA.2.75 имеет девять мутаций в ключевых областях шиповидного белка (D339H, G446S, N460K, реверсия R493Q в RBD, K147E, W152R, F157L, I210V, G257S в NTD). Он особенно распространен в Индии, где B2 все еще доминирует, а B5 циркулирует на более низких уровнях.

В целом в мире происходит активная циркуляция различных штаммов, что способствует непрекращающемуся сотрудничеству ученых всего мира, у которых есть общая база для занесения в нее данных о новых мутациях. А так же о возможных способах торможения эпидемии. Профилактика, лечение, вакцинация важные факторы, на которые врачи и ученые мира обращают внимание при наблюдении за пандемией, перенимают опыт друг друга, приходят к общим знаменателям.

В конечных рекомендациях до сих пор присутствуют такие постулаты, как – ношение масок, ограничение контактов, использование гелей с антисептиками, применение интерферона альфа 2б в качестве профилактического способа защиты от вируса.

Ученые отмечают, что на данный момент, с учетом циркуляции новых штаммов, нет никаких тревожных сигналов, которые бы вызывали необходимость усилить меры по защите населения планеты, вводить карантины, создавать новые вакцины.
Татьяна Семенченя