Блог Валерия Владимировича Клюваев

Вирусный конструктор: ИИ научился находить гибридные штаммы (RecombinHunt / Nature 2024)

2024-07-11 07:30 Наука и Исследования
Вирусология / Биоинформатика

Вирусный конструктор: Как рождаются новые штаммы?

Эволюция вирусов — это не только случайные мутации. Существует более мощный механизм — рекомбинация. Это процесс, когда вирусы обмениваются целыми блоками генов, создавая принципиально новые виды. И теперь у нас есть инструмент, чтобы это отследить.

Смертельный обмен

Обмен генетическим материалом (ДНК или РНК) может происходить между вирусами животных и человека. Результат такой «сделки» часто катастрофичен.

🦇 Пример SARS-CoV-2

Изначально вирус жил в летучих мышах и панголинах. Произошедшая рекомбинация превратила его в патоген, способный убивать людей.

Масштаб эволюции: За время пандемии вирус накопил более 130 000 мутаций, породив более 2 000 новых линий.

Охота на мутантов

💻

RecombinHunt

Авторы исследования в Nature Communications представили новую компьютерную программу. Она использует передовые алгоритмы для распознавания рекомбинантных геномов.

  • Работает с любыми эпидемическими вирусами.
  • Высокая точность детекции.
  • Сокращенные сроки анализа (позволяет прогнозировать угрозы).

Личная биозащита

Пока суперкомпьютеры вычисляют новые штаммы, наша задача — защищаться здесь и сейчас. Профилактическое использование рекомбинантного интерферона-альфа 2b (например, в виде геля) помогает укрепить барьер против любых вирусов, независимо от их генетических хитростей.

Источник (Nature Communications, 2024):

Alfonsi, T., Bernasconi, A., Chiara, M. et al.
Data-driven recombination detection in viral genomes.