Мутации коронавируса

Мутации коронавируса на очередной волне коронавируса

Мутации коронавируса на очередной волне коронавируса резкое увеличение заболеваемости в станах Европы и Америки.

Неблагополучная эпидемиологическая обстановка в мире, резкое увеличение заболеваемости в станах Европы и Америки, ведет к мутации коронавируса SARS-CoV-2 что свидетельствуют о возможных рисках начала 3-й волны пандемии и в Российской Федерации. По данным на дату написания статьи – 19 апреля 2021 года, общее количество зараженных вирусом SARS-CoV-2 в мире составляет более 142 млн. человек, число погибших – более 3 млн. Таким образом, количество случаев заражения за последние 2 недели – с 06.04.21 по 19.04.21 увеличилось на 10 млн.человек. [1].

Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) изменила маркировку новых штаммов коронавируса SARA-CoV-2
России на эту же дату общее число заболевших составляет более 4,5 млн.человек, погибших – более 105 тысяч человек [2].
Показатель в расчете на 100 тыс.населения
Страна Колличество смертей от COVID-19
Великобритания 201,8
Италия 192,7
Бразилия 181,8
США 175,0
Испания 165,8
Франция 151,2
Россия 70,7
Важным коэффициентом степени распространения вируса является показатель Rt – как отношение числа новых выявленных случаев заражения за последние 4 дня к числу новых случаев за предыдущие 4 дня. Значение показателя > 1 говорит об ухудшении эпидемиологической ситуации и большем распространении инфекции. В Индии, Бразилии, Турции, Италии показатель Rt по данным от 18.04.21 превышает значение 1. В России такой показатель равен 1,07, в США – 0,92 [3]. Приведенные сведения убедительно свидетельствуют о 3-й волне пандемии, которая официально зафиксирована вво многих странах мира. Данные обстоятельства связаны с формированием и широким распространением штаммов коронавируса SARS-CoV-2, подвергшимся генетическим мутациям.

Главные мутации коронавируса происходят в гене гликопротеинового S-белка (D614G), RBD-домене (N501Y) и сайте расщепления фурином (P681H). Так, мутация в S белке приводит к замене аспарагиновой аминокислоты (сокращенно D) на аминокислоту глицин (сокращенно G). Американские исследователи экспериментально показали, что давно обсуждаемая мутация D614G в гене S-белка коронавируса SARS-CoV-2 повышает его инфекционность, поэтому данный вариант вируса распространяется быстрее. Вирусный белок с такой мутацией также и более стабилен. 

Мутации в рецептор-связывающем домене (RBD-receptor binding domain), обладают более высоким сродством к рецептору ангиотензин-превращающего фермента 2 типа (АСЕ2) эпителиальных клеток человека, что позволяет коронавирусу увереннее в них проникать.

Основные мутационные линии вируса SARS-CoV-2:
Основные мутационные линии вируса SARS-CoV-2:

Основные мутационные линии вируса SARS-CoV-2:Мутации коронавируса

По данным Роспетребнадзора, на 16.апреля 2021 года в РФ идентифицированы 192 образца британского штамма, 21 – южноафриканского штамма [6-9].

Исследователи из Великобритании сообщили, что риск смерти у людей, зараженных «британским» штаммом B.1.1.7, выше, чем у зараженных другими штаммами, в среднем на 64%. Абсолютный риск смерти возрастает от 2,5 до 4,1 смертей на 1000 случаев заражения [10].

Ученые из Кейптауна и Йоханнесбурга (ЮАР) исследовали антитела у 89 человек, госпитализированных с COVID-19 в начале 2021 года. Авторы показали, что COVID-19, перенесенный во время первой волны, не дает защиты от некоторых новых вариантов вируса. Однако у людей, инфицированных «южноафриканским» штаммом SARS-CoV-2, есть нейтрализующие антитела против старых вариантов вируса, а также против «бразильского» штамма.

Ученые из США исследовали когорту беременных и кормящих матерей, получивших вакцину Pfizer/BioNTech или Moderna. Они показали, что уровни IgG, IgA и IgM к S-белку и рецептор-связывающему домену (RBD) увеличивались в крови женщин из обеих групп. Антитела, особенно IgG, передавались ребенку через плаценту и материнское молоко. Авторы показали, что материнские IgG могут преодолевать плацентарный барьер. IgG к S-белку и RBD-домену были обнаружены во всех десяти образцах пуповинной крови. Уровень антител к SARS-CoV-2 был значительно выше у вакцинированных женщин, чем у переболевших COVID-19 а концентрация IgG в крови матери увеличивалась после второй дозы вакцины [12].

Данный факт свидетельствует в пользу проведения вакцинации данного контингента.

Японские ученые, в частности Yoriyuki Konno с соавторами в работе 20 года показали, что белок, экспрессируемый с гена ORF3b нового коронавируса SARS-CoV-2 сильно подавляет синтез интерферонов I типа у пациентов с COVID-19./ При этом вирус чувствителен к интерферонам, что говорит об их потенциальной эффективности для терапии коронавирусной инфекции [13].

Схема ингибирования синтеза ИНФа вирусом SARS-CoV-2
Белки SARS-CoV-2 структурные (M, N) и неструктурные (ORF, NS4a, NS4b, NS15)Влияние на синтез интерферона в клетке
3bПодавление синтеза IFN I типа
6Подавление синтеза IFN I типа
8Взаимодействие в белками главного комлекса гистосовместмимости MHC-I и уменьшение их количества на мембранах клеток рахных типов
9bПодавление синтеза IFN типа

В этой связи, в клиническом плане представляется целесообразным в качестве мер активной противовирусной защиты обеспечить пациентам назначение препаратов рекомбинантного интерферона –α2b с антиоксидантами, как в довакцинный период, когда идет процесс образования вируснейтрализующих антител, так и в поздний поствакцинный период, когда титр антител после проведенной вакцинации начинает снижаться. Примером такого комплексного интерферонсодержащего лекарственного средства является отечественный препарат Виферон.

  1. https://coronavirus-monitor.ru/
  2. https://стопкоронавирус.рф/
  3. https://yandex.ru/covid19/stat
  4. Zhang l., et al. // The D614G mutation in the SARS-CoV-2 spike protein reduces S1 shedding and increases infectivity. // bioRxiv preprint, 2020, DOI: 10.1101/2020.06.12.148726;
  5. Wrapp, D. Wang N., Corbett K.S., Goldsmith J.A. et al. Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation // Science 13 Mar 2020:Vol. 367, Issue 6483, pp. 1260-1263;
  6. Zhang W., et al. // Emergence of a Novel SARS-CoV-2 Variant in Southern California // JAMA. published online February 11, 2021, DOI: 10.1001/jama.2021.1612;
  7. Walensky R.P., Walke H.T., Fauci A.S., SARS-CoV-2 Variants of Concern in the United States-Challenges and Opportunities // JAMA. 2021;325(11):1037-1038. doi:10.1001/jama.2021.2294;
  8. https://spid.center/ru/articles/2937
  9. https://www.kommersant.ru/doc/4781182
  10. Challen R., et al. // Risk of mortality in patients infected with SARS-CoV-2 variant of concern 202012/1: matched cohort study // BMJ 2021;372:n579, published March 10, 2021, DOI: 10.1136/bmj.n579;
  11. Тhandeka Moyo-Gwete, et al. // SARS-CoV-2 501Y.V2 (B.1.351) elicits cross-reactive neutralizing antibodies. // bioRxiv, 2021, DOI: 10.1101/2021.03.06.434193v2;
  12. Gray K.J., et al. // COVID-19 vaccine response in pregnant and lactating women: a cohort study // AJOG, published March 25, 2021, DOI: 10.1016/j.ajog.2021.03.023;
  13. Konno Y. et al. SARS-CoV-2 ORF3b is a potent interferon antagonist whose activity is further increased by a naturally occurring elongation variant. //bioRxiv, May 12, 2020; DOI: 10.1101/2020.05.11.088179;
Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован.

двенадцать − два =

Статьи по теме
Профилактика ОРВИ

Профилактика ОРВИ и Covid-19

Аудиоверсия статьи Лечение коронавирусных инфекций представляет собой довольно сложную клиническую задачу. Известно, что в процессе биологической эволюции природа наградила организм человека великолепным механизмом противостояния вирусным атакам, который реализован в системе…

Аллергия как триггер роста ОРВИ и Covid-19

Проблема усиления заболеваемости ОРВИ, включая инфекцию COVID-19 в период сезонных поллинозов является весьма актуальной для мирового здравоохранения и фармацевтики. Известно, что инфекционные и неинфекционные антигены могут способствовать дополнительной сенсибилизации организма,…

Профилактика ОРВИ у новорожденных детей и их матерей в условиях пандемии covid-19

Полный список авторов И.И. БОЧАРОВА, доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник отделения неонатологии Московского областного научно-исследовательского института акушерства и гинекологии Н.В. ЗАРОЧЕНЦЕВА, доктор медицинских наук, профессор РАН, заместитель директора по научной работе…

Психические нарушения при covid-19

Многие вирусные инфекции в ряде случаев могут поражать центральную нервную систему, вызывая различные психоневрологические нарушения, включая когнитивные, аффективные, поведенческие и другие расстройства [1].  Подобно двум другим смертельным респираторным коронавирусам –…

Новые данные о вирусе SARS CoV-2

В последнее время в мировой медицинской литературе появляются новые данные о молекулярно-биологических особенностях нового коронавируса SARS-CoV-2, его воздействии на органы и ткани, рассматриваются варианты клинического течения вызываемого им заболевания COVID-19.…

Обзор фармакологических особенностей интерфероновых препаратов

Известно, что в процессе биологической эволюции природа наградила организм человека великолепным механизмом противостояния вирусным атакам, который реализован в системе цитокиновых белков – интерферонов…