Современные научные представления о штамме «Омикрон» и его влиянии на пандемию коронавирусной инфекциии Covid-19

Впервые о новой мутации коронавируса SARS-CoV-2 заговорили в ноябре 2021 года, когда этот вариант вируса был обнаружен в Южной Африке. В дальнейшем ВОЗ присвоила новому штамму литеру «омикрон» и отнесла его к вариантам, вызывающим опасения [1].

Новая разновидность коронавируса отличается от предыдущих вариантов большим количеством мутаций – их около 60 и большинство из них расположено в S-белке, а конкретнее – в рецептор-связывающем домене, который расположен на самой вершине шиповидного рецептора коронавируса [2,3,4].

Филогенетический анализ показал, что «омикрон» тесно связан с вариантом «гамма» (П.1). Кроме того, мутации отмечены в других структурных антигенных белках вируса: нуклеокапсидном белке (N), белке мембраны (M), оболочечном белке (Е) [5].

Наличие данных мутаций позволило вирусу стать более трансмиссивным (т.е. увеличилась вероятность заражения при контактах) и более уклончивым от иммунного ответа. Сами мутации связаны с заменой одних аминокислот на другие в молекуле белка, а изменение электрического заряда на белковой поверхности может приводить к снижению аффинности антител (т.е. способности антигена и антитела образовывать единый комплекс), в результате чего антитела не могут блокировать S-белок коронавируса. По сути, новый штамм «омикрон» становится более устойчивым к вирус-нейтрализующим антителам [6].

По сравнению с вариантом «дельта», штамм «омикрон» обладает более высоким родством к рецептору ангиотензин-превращающего фермента-2 (АСЕ2), расположенного на мембране эпителиальной клетки, к которому прикрепляется S-белок коронавируса – отсюда и высокий потенциал передачи инфекции, поскольку именно рецептор АСЕ2 является основной мишенью для коронавируса. В отличие от штамма «дельта», в «омикроне» весь спайковый белок (S) и рецептор-связывающий домен (RBD) содержат высокую долю гидрофобных аминокислот, таких как фенилаланин, лейцин и др. [7]

По данным литературных источников, штамм «омикрон» может быть в 10 раз более заразным, чем исходный, «уханьский» вирус и в 2 раза более заразным, чем штамм «дельта». Более того, существуют опасения, что у «омикрона» в 2 раза больше шансов противостоять действию современных вакцин, чем у предыдущего варианта коронавируса «дельта» [8].

И действительно, в научной печати появились публикации, доказывающие, что «омикрон» имеет более низкую нейтрализующую чувствительность (по сравнению с другими штаммами вируса SARS-CoV-2) к вакцинным препаратам, особенно бустерного типа. Так, в одной из работ указывается, что после иммунизации вакциной Pfizer-BioNTech титры нейтрализующих антител снизились (применительно к «омикрон» варианту) в 41 раз [9,10].

Вместе с тем, по мнению исследователей, вакцинация остается одним из ведущих способов профилактики снижения заболеваемости от штамма «омикрон», а по данным отечественных ученых, эффективность сочетанного применения рекомендованных доз вакцины «Спутник V» и бустерной дозы вакцины «Спутник Лайт», в случае с «омикроном» может составить более 80% [11].

  1. https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern
  2. Gong S.Y., Chatterjee D., Richard J., et al. Contribution of single mutationstoselectedSARS-CoV-2 emerging variants spike antigenicity.// Virology.2021;563:134-145. 21.
  3. Benvenuto D., Angeletti S.,Giovanetti M.et al.Evolutionaryanalysis of SARS-CoV-2: how mutation of non-structural protein 6 (NSP6) could affect viral autophagy.//J Infect.2020;81(1):e24-e27.
  4. Ingraham N.E., Ingbar D.H. The omicron variant of SARS-CoV-2: Understanding the known and living with unknowns // Clin.Transl.Med.2021;11:e685. DOI:10.1002/ctm2.685
  5. Kannan S.R., Spratt A.N., Sharma K. et al. Omicron SARS-CoV-2 variant: Unique features and their impact on pre-existing antibodies // J Autoimmun 2021 Dec 13;126:102779. doi: 10.1016/j.jaut.2021.102779.
  6. Ford C.T., Machado D.J., Janies D.A. Predictions of the SARS-CoV-2 Omicron Variant (B.1.1.529) Spike Protein Receptor-Binding Domain Structure and Neutralizing Antibody Interactions // bioRxiv (2021), published December 06, 2021, DOI: 10.1038/s41586-021-04248-x
  7. Kumar S., Thambiraja T.S., Karuppanan K., Subramaniam G. Omicron and Delta Variant of SARS-CoV-2: A Comparative Computational Study of Spike Protein // J Med Virol2021 Dec 15. PMID: 34914115 doi: 10.1002/jmv.27526.
  8. Chen J., Rui Wang R et al. Omicron (B.1.1.529): Infectivity, vaccine breakthrough, and antibody resistance // ArXiv 2021 Dec 1;arXiv:2112.01318v1. PMID: 34873578,PMCID: PMC8647651
  9. Ai J., Zhang H., , Zhang Yi., Lin Ke et al. Omicron variant showed lower neutralizing sensitivity than other SARS-CoV-2 variants to immune sera elicited by vaccines after boost // Emerg Microbes Infect 2021 Dec 22;1-24. PMID: 34935594 doi: 10.1080/22221751.2021.2022440
  10. Wilhelm A. et al. Reduced Neutralization of SARS-CoV-2 Omicron Variant by Vaccine Sera and monoclonal antibodies // medRxiv, 2021, DOI: 10.1101/2021.12.07.21267432v1
  11. Сайт sputnikvaccine.com https://sputnikvaccine.com/newsroom/pressreleases/sputnik-v-induces-robust-neutralizing-antibody-response-to-omicron-variant-which-is-further-strength/
Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

13 + 18 =

Статьи по теме
Профилактика ОРВИ

Профилактика ОРВИ и Covid-19

Слушать статью Лечение коронавирусных инфекций представляет собой довольно сложную клиническую задачу. Известно, что в процессе биологической эволюции природа наградила организм человека великолепным механизмом противостояния вирусным атакам, который реализован в системе…

Аллергия как триггер роста ОРВИ и Covid-19

Проблема усиления заболеваемости ОРВИ, включая инфекцию COVID-19 в период сезонных поллинозов является весьма актуальной для мирового здравоохранения и фармацевтики. Известно, что инфекционные и неинфекционные антигены могут способствовать дополнительной сенсибилизации организма,…

Профилактика ОРВИ у новорожденных детей и их матерей в условиях пандемии covid-19

Полный список авторов И.И. БОЧАРОВА, доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник отделения неонатологии Московского областного научно-исследовательского института акушерства и гинекологии Н.В. ЗАРОЧЕНЦЕВА, доктор медицинских наук, профессор РАН, заместитель директора по научной работе…

Психические нарушения при covid-19

Многие вирусные инфекции в ряде случаев могут поражать центральную нервную систему, вызывая различные психоневрологические нарушения, включая когнитивные, аффективные, поведенческие и другие расстройства [1].  Подобно двум другим смертельным респираторным коронавирусам –…

Новые данные о вирусе SARS CoV-2

В последнее время в мировой медицинской литературе появляются новые данные о молекулярно-биологических особенностях нового коронавируса SARS-CoV-2, его воздействии на органы и ткани, рассматриваются варианты клинического течения вызываемого им заболевания COVID-19.…

Обзор фармакологических особенностей интерфероновых препаратов

Известно, что в процессе биологической эволюции природа наградила организм человека великолепным механизмом противостояния вирусным атакам, который реализован в системе цитокиновых белков – интерферонов…