|
Диагностика

Лабораторная диагностика COVID-19: от ПЦР и ИФА до D-димера

Обзор современных лабораторных методов при COVID-19: как выявляют вирус и антитела, какие маркеры помогают оценить тяжесть болезни и зачем определять интерфероновый статус.

Время чтения: 2 минИсточников: 1
Лабораторная диагностика COVID-19
Содержание
  1. ПЦР — «золотой стандарт» диагностики
  2. LAMP, ИФА и экспресс-тесты
  3. Оценка тяжести COVID-19
  4. Интерфероновый статус
Главное
  • «Золотой стандарт» диагностики COVID-19 — ОТ-ПЦР, которая в реальном времени определяет компоненты РНК коронавируса.
  • Метод LAMP не требует лаборатории, а экспресс-тесты на основе иммунохроматографии выявляют иммуноглобулины за 10–15 минут.
  • Для оценки тяжести исследуют СРБ, прокальцитонин, показатели свёртывания крови, D-димер и воспалительные цитокины.
  • Низкий уровень интерферона-α в плазме крови учёные рассматривают как маркер риска критического состояния.

ПЦР — «золотой стандарт» диагностики

Стратегия борьбы с пандемией инфекции COVID-19 напрямую зависит от качества лабораторных методов исследования, а «золотым стандартом» диагностики COVID-19 были и остаются анализы на основе метода полимеразной цепной реакции с обратной транскриптазой (rRT-PCR или ОТ-ПЦР), позволяющие в реальном режиме времени определять компоненты РНК коронавируса [1,2].

LAMP, ИФА и экспресс-тесты

К сожалению, ОТ-ПЦР требует наличия специализированной лаборатории и дорогостоящего оборудования. Но метод петлевой изотермальной амплификации (LAMP), также применяемый для детекции вирусной РНК, не требует лаборатории и может выполняться в формате «у постели больного». Иммуноферментный анализ (ИФА) позволяет определять вирус-специфические антитела, однако и этот метод требует лабораторного оборудования. А вот экспресс-тесты на основе метода иммунохроматографии на твердофазном носителе могут ответить на вопрос наличия иммуноглобулинов в течение 10-15 минут [3].

Сегодня молекулярная диагностика использует такие методы, как петлевая изотермическая амплификация с обратной транскрипцией (ОТ-LAMP) и амплификация рекомбинантной полимеразы обратной транскрипции (ОТ-PRA), а также технологии редактирования генома CRISPR/Cas для создания высоко-чувствительных тест-систем для детекции РНК коронавируса SARS-CoV-2 на основе методик DETECTR и SHERLOCK [4-6].

Анализы для оценки тяжести COVID-19

С целью определения степени тяжести больного и формирования исходов заболевания, в клинике исследуют уровни С-реактивного белка (СРБ) и прокальцитонина, изучают биомаркеры свертывания крови - активированного частичного тромбопластинового времени, протромбинового индекса, фибриногена, а также D-димера, повышенные титры которого являются плохим прогностическим критерием, связанным с тяжелыми осложнениями и даже гибелью пациента [8,9].

Важным лабораторным показателем является детекция уровня воспалительных цитокинов, таких как GCSF, IL-2, MCP1, IL-6, IL-7, IL-10, MIP1A, IP10 и TNFα [10].

Интерфероновый статус

И наконец, самый главный анализ – оценка интерферонового статуса (ИФН-статус). Дефицит основного противовирусного белка-интерферона коррелирует с тяжестью патологического процесса при инфекции COVID-19: у пациентов в тяжелом и критическом состоянии снижена экспрессия генов, кодирующих интерфероны I типа, и соответственно, подавлен синтез интерферонов. Низкий уровень интерферона-ɑ (ИНФ-α) в плазме крови ученые рассматривают как маркер, указывающий на риск развития критического состояния [11].

Таким образом, снижение продукции ИНФ-α говорит о дефектности системы интерферона и является показанием для ИФН-стимулирующей терапии, а оценка показателей ИФН-статуса позволяют судить об иммунореактивности организма в целом (12-16).

Безусловно, приведённые здесь методы лабораторной диагностики COVID-19 не являются исчерпывающими, в каждом конкретном случае спектр анализов может быть существенно расширен.

Частые вопросы

Какой метод считается «золотым стандартом» диагностики COVID-19?

Анализы на основе ОТ-ПЦР, которые позволяют в реальном времени определять компоненты РНК коронавируса. Метод требует специализированной лаборатории и дорогостоящего оборудования.

Зачем при COVID-19 определяют D-димер?

Это биомаркер свёртывания крови: его повышенные титры — плохой прогностический критерий, связанный с тяжёлыми осложнениями и даже гибелью пациента.

Что показывает интерфероновый статус?

Дефицит интерферона коррелирует с тяжестью COVID-19, а низкий уровень интерферона-α в плазме рассматривают как маркер риска критического состояния. Оценка ИФН-статуса позволяет судить об иммунореактивности организма в целом.

Источники

  1. Амвросьева Т., Поклонская Н. SARS‑CoV‑2: лабораторная диагностика

Материал носит информационный характер и не заменяет консультацию врача. При симптомах заболевания обратитесь к специалисту.