Вариант «Омикрон» (B.1.1.529) стал одним из поворотных моментов пандемии COVID-19. Рассказываем, как он появился в конце 2021 года и что крупные исследования того периода выяснили о его распространении, тяжести и ускользании от иммунитета.
- Первый подтверждённый образец «Омикрона» взят 9 ноября 2021 года; 26 ноября ВОЗ признала его вариантом, вызывающим обеспокоенность.
- За три недели вариант выявили в 87 странах; он нёс более 30 мутаций в шиповидном белке.
- Нейтрализация «Омикрона» антителами после вакцинации снижалась примерно в 22 раза, а эффективность двух доз вакцины против симптомной инфекции быстро падала; ревакцинация её частично восстанавливала.
- Риск госпитализации при «Омикроне» в Англии был на 59% ниже, чем при «Дельте», однако у детей до 10 лет разница не подтвердилась.
- Часть различий в тяжести объясняется популяционным иммунитетом, поэтому оценить «собственную» опасность варианта сложно.
Как появился «Омикрон»: хронология
В ноябре 2021 года службы геномного надзора Южно-Африканской Республики и Ботсваны обнаружили новый вариант SARS-CoV-2, связанный с быстрым ростом заболеваемости в провинции Гаутенг [Viana, 2022]. По данным ВОЗ, первый известный подтверждённый образец был взят 9 ноября 2021 года, о варианте B.1.1.529 сообщили в ВОЗ из ЮАР 24 ноября, а 26 ноября Техническая консультативная группа ВОЗ рекомендовала признать его вариантом, вызывающим обеспокоенность, и дать ему название «Омикрон» [ВОЗ, 2021].
Через три недели после публикации первого генома вариант был выявлен в 87 странах. Его отличительная черта — более 30 мутаций в шиповидном (спайковом) белке, которые, по прогнозам, влияли на нейтрализацию антителами и функцию белка [Viana, 2022].
Почему вариант распространялся так быстро
Быстрый рост числа случаев наблюдался даже там, где у населения уже был высокий уровень иммунитета после перенесённой инфекции и вакцинации [Viana, 2022]. Исследователи рассматривали два объяснения — ускользание от иммунитета и собственные биологические свойства вируса.
- Ускользание от антител. В лабораторной работе нейтрализация «Омикрона» антителами вакцинированных препаратом BNT162b2 снизилась примерно в 22 раза по сравнению с исходным вариантом. У людей, которые и переболели, и были вакцинированы, остаточная нейтрализация «Омикрона» была на уровне нейтрализации исходного вируса у только вакцинированных [Cele, 2022].
- Свойства вируса. На культурах тканей человека «Омикрон» размножался быстрее всех изученных вариантов в бронхах, но менее эффективно — в лёгочной ткани. Он в большей степени зависел от ферментов катепсинов, то есть, вероятно, входил в клетки иным путём [Hui, 2022].
Был ли «Омикрон» менее тяжёлым
Первые данные пришли из ЮАР. В качестве косвенного признака «Омикрона» использовали выпадение мишени гена S в ПЦР-тесте: доля таких случаев выросла с 3,2% на 39-й неделе до 97,9% на 48-й неделе 2021 года. Шансы госпитализации при таких инфекциях были ниже (скорректированное ОШ 0,2), а среди госпитализированных шансы тяжёлого течения по сравнению с более ранними случаями «Дельты» составили 0,3 [Wolter, 2022].
Крупное когортное исследование в Англии подтвердило эту картину. По сравнению с «Дельтой» риск обращения в больницу при «Омикроне» был ниже (ОР 0,56), риск госпитализации — ОР 0,41, риск смерти — ОР 0,31 [Nyberg, 2022].
| Возраст | Риск госпитализации при «Омикроне» относительно «Дельты» (ОР) |
|---|---|
| Младше 10 лет | 1,10 (95% ДИ 0,85–1,42) — различие не подтверждено |
| 60–69 лет | 0,25 |
| 80 лет и старше | 0,47 |
| Невакцинированные (все возрасты) | 0,30 |
Перенесённая ранее инфекция давала определённую защиту от смерти при обоих вариантах — как у вакцинированных (ОР 0,47), так и у невакцинированных (ОР 0,18). При этом ВОЗ ещё в ноябре 2021 года указывала на предварительные данные о повышенном риске повторного заражения «Омикроном» по сравнению с другими вариантами [Nyberg, 2022; ВОЗ, 2021].
Данные по невакцинированным важны: они показывают, что более низкий риск госпитализации при «Омикроне» сохраняется и без учёта защиты от вакцины.
Как работали вакцины против «Омикрона»
Исследование «случай — контроль» с отрицательным тестом в Англии включило 886 774 случая «Омикрона», 204 154 случая «Дельты» и 1 572 621 человека с отрицательным тестом. Против симптомной инфекции вакцины во всех схемах работали хуже в отношении «Омикрона», чем «Дельты» [Andrews, 2022].
- После двух доз BNT162b2 эффективность составляла 65,5% через 2–4 недели и снижалась до 8,8% через 25 недель и более.
- Через 20 недель после двух доз ChAdOx1 nCoV-19 защитного эффекта против «Омикрона» не отмечено.
- Ревакцинация BNT162b2 после первичного курса BNT162b2 повышала эффективность до 67,2% через 2–4 недели, к 10-й неделе и позже — 45,7%.
- Ревакцинация mRNA-1273 после курса BNT162b2 давала 73,9% через 2–4 недели и 64,4% через 5–9 недель.
Ограничения исследований и спорные вопросы
- Косвенные маркеры. В южноафриканской работе вариант определяли по выпадению гена S, а не секвенированием каждого образца.
- Популяционный иммунитет. К моменту прихода «Омикрона» многие уже переболели или были вакцинированы, поэтому трудно отделить свойства вируса от защиты, накопленной населением.
- Ограниченный период. Английская когорта охватывала случаи с 29 ноября 2021 года по 9 января 2022 года — результаты относятся к первым сублиниям «Омикрона».
- Ограничения дизайна. Исследования «случай — контроль» с отрицательным тестом зависят от того, кто и когда тестируется; оценки эффективности вакцин касаются симптомной инфекции, а не тяжёлого течения.
- Лабораторные данные. Результаты на культурах тканей объясняют механизмы, но не заменяют клинических наблюдений.
Частые вопросы
Когда появился штамм «Омикрон»?
Первый известный подтверждённый образец взят 9 ноября 2021 года; 24 ноября о варианте сообщили в ВОЗ из ЮАР, а 26 ноября его признали вариантом, вызывающим обеспокоенность.
Был ли «Омикрон» легче «Дельты»?
По данным английского когортного исследования, риск госпитализации при «Омикроне» был ниже (ОР 0,41), риск смерти — ОР 0,31. У детей младше 10 лет разница в риске госпитализации не подтвердилась.
Защищали ли вакцины от «Омикрона»?
Защита от симптомной инфекции была ниже, чем против «Дельты», и быстро снижалась после двух доз. Ревакцинация повышала эффективность до 67,2–73,9% через 2–4 недели в зависимости от схемы.
Почему «Омикрон» распространялся так быстро?
Вариант в значительной степени ускользал от нейтрализующих антител, а в лабораторных моделях быстрее других размножался в тканях бронхов.
Источники
- ВОЗ. Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern, 26.11.2021
- Viana R. et al. Rapid epidemic expansion of the SARS-CoV-2 Omicron variant in southern Africa. Nature, 2022
- Cele S. et al. Omicron extensively but incompletely escapes Pfizer BNT162b2 neutralization. Nature, 2022
- Hui K.P.Y. et al. SARS-CoV-2 Omicron variant replication in human bronchus and lung ex vivo. Nature, 2022
- Wolter N. et al. Early assessment of the clinical severity of the SARS-CoV-2 omicron variant in South Africa. Lancet, 2022
- Nyberg T. et al. Risks of hospitalisation and death associated with SARS-CoV-2 omicron and delta variants in England: a cohort study. Lancet, 2022
- Andrews N. et al. Covid-19 Vaccine Effectiveness against the Omicron (B.1.1.529) Variant. N Engl J Med, 2022
Материал носит информационный характер и не заменяет консультацию врача. Перед применением лекарственных препаратов ознакомьтесь с инструкцией и проконсультируйтесь со специалистом.